(1)出资人不同。个人独资企业只能由自然人出资设立，一人公司既可以由自然人出资设立，也可以由法人出资设立，还可以由国家出资设立。
(2)主体资格不同。个人独资企业属于非法人组织，不具有法人资格，一人公司作为公司的一种，是企业法人，在公司成立时取得法人资格。
(3)责任承担不同。个人独资企业的投资人对企业的债务承担无限责任；一人公司的投资人（股东）仅以出资额为限对公司负责，即负有限责任。
(4)注册资本要求不同。对个人独资企业，法律并无最低注册资本的要求，而一人公司法律有最低注册资本的要求，依据《公司法》的规定，其最低注册资本为10万元，且需在公司成立时一次足额缴纳。
(5)设立的法律依据不同。个人独资企业依照个《人独资企业法》设立；一人公司则须依照《公司法》设立。

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